包括作為教學實體的院系、中心、研究院（獨立主體研究機構） | |||||||
| 建築學院 | |||||||
| 經濟管理學院 | |||||||
| 土木水利學院 | |||||||
| 公共管理學院 | |||||||
| 環境學院 | |||||||
| 馬克思主義學院 | |||||||
| 機械工程學院* | |||||||
| 人文學院 | |||||||
| 社會科學學院 | |||||||
| 航天航空學院 | |||||||
| 信息科學技術學院* | |||||||
| 法學院 | |||||||
| 新聞與傳播學院 | |||||||
| 五道口金融學院 | （與中國人民銀行合作，原為中國人民銀行研究生部） | ||||||
| 人工智慧學院 | |||||||
| 材料學院 | |||||||
| 美術學院 |
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| 安全科學學院 | |||||||
| 理學院* | |||||||
| 教育學院 | |||||||
| 生命科學學院 | |||||||
| 醫學院 |
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| 萬科公共衛生與健康學院 | |||||||
| （研究院） | |||||||
| （無學院建制的系） | |||||||
| （無學院建制的學院） | |||||||
| （住宿書院） | |||||||
| （教學單位） | |||||||
| 北京協和醫學院 （清華大學醫學部） | |||||||
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星號*：非實體學院。 | |||||||