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內大核亞門

域：真核生物域
演化支：雙鞭毛生物
演化支：SAR超類群
演化支：囊泡蟲類
門：纖毛蟲門

- 參見纖毛蟲門

內大核亞門

- 見下 ↓

內大核亞門

內
大
核
亞
門

原克魯蟲綱（英語：Protocruziea）	原克魯蟲目（英語：Protocruziida）原克魯蟲科（英語：Protocruziidae）
CON3P（英語：Ventrata）	參見 CON3P

S
A
L

奇形蟲科（英語：Caenomorphidae）
麗克目（英語：Licnophorida）	麗克蟲科（英語：Licnophoridae）
凱毛目（英語：Licnophorida）	凱毛蟲科（英語：Kiitrichidae）
齒口綱（英語：Odontostomatae）	齒口目（英語：Odontostomatida） Discomorphellidae（英語：Discomorphellidae） Epalxellidae（英語：Epalxellidae） Mylestomatidae（英語：Mylestomatidae）
薄咽目（英語：Phacodiniida）	薄咽蟲科（英語：Phacodiniidae）
旋毛綱	見下↓
葉口綱	見下↓

A
+
C
+
M

卡里亞科蟲綱（英語：Cariacotrichea）

卡里亞科纖蟲目（英語：Cariacotrichida）
- 卡里亞科蟲科（英語：Cariacotrichidae）

副睫赭纖蟲綱（英語：Parablepharismea）

副睫赭纖蟲目（英語：Parablepharismida）
- 副睫赭蟲科（英語：Parablepharismidae）

穆拉諾纖蟲綱（英語：Muranotrichea）

穆拉諾纖蟲目（英語：Muranotrichida）
- 穆拉諾蟲科（英語：Muranotrichidae）

瓶纖綱（英語：Armophorea）

"扭頭目"（英語：Metopida）	盔帽蟲科（英語：Apometopidae） "紐頭蟲科（英語：Metopidae）" Tropidoatractidae（英語：Tropidoatractidae）
克氏目（英語：Clevelandellida）	克氏蟲科（英語：Clevelandellidae）下口蟲科（英語：Inferostomatidae）新腸腎科（英語：Neonyctotheridae） "腸腎科" 籽核蟲科（英語：Sicuophoridae）

游僕亞綱（英語：Euplotia）	游僕目纖蟲科（英語：Aspidiscidae）塞特斯蟲科（英語：Certesiidae）游僕蟲科（英語：Euplotidae）腹棘蟲科尾刺蟲科（英語：Uronychiidae）頭盤目（英語：Discocephalida）頭盤蟲科（英語：Discocephalidae）偽小雙蟲科（英語：Pseudoamphisiellidae）

周
膜
類（英語：Perilemmaphora）

下
毛
亞
綱

"排毛目"
- 小雙蟲科
- 紡錘蟲科（英語：Atractosidae）
- 布蘭蟲科（英語：Bourlandellidae）
- 絲旋蟲科（英語：Chaetospiridae）
- Deviatidae（英語：Deviatidae）
- 額斜蟲科
- 角口蟲科（英語：Gonostomatidae）
- 彈跳蟲科
- 全列蟲科（英語：Holostichidae）
- 卡爾蟲科
- 角豆蟲科（英語：Keronopsidae）
- 新角毛蟲科（英語：Neokeronopsidae）
- "尖毛科"
- 擬雙棘蟲科（英語：Parabirojimidae）
- 沙冠蟲科（英語：Psammomitridae）
- 斜口蟲科（英語：Plagiotomidae）
- 裸毛蟲科（英語：Psilotrichidae）
- 硬毛蟲科（英語：Rigidotrichidae）
- 施密丁格蟲科（英語：Schmidingerotrichidae）
- 旋纖蟲科（英語：Spirofilidae）
- 圓纖蟲科（英語：Strongylidiidae）
- 尖頸蟲科（英語：Trachelostylidae）
- 小尾蟲科（英語：Uroleptidae）

"尾柱目"
- 伯傑蟲科（英語：Bergeriellidae）
- 克蘭普蟲科（英語：Clampidae）
- 半環柱蟲科（英語：Hemicycliostylidae）
- 擬角毛蟲科（英語：Pseudokeronopsidae）
- 擬尾柱蟲科（英語：Pseudourostylidae）
- 尾柱蟲科（英語：Urostylidae）

寡
毛
亞
綱

林氏目（英語：Lynnellida）
- 林氏科（英語：Lynnellidae）
寡毛目（英語：Oligotrichida）
- 管游蟲科（英語：Cyrtostrombidiidae）
- 浮游蟲科（英語：Pelagostrombidiidae）
- "急游蟲科"
- 曳尾蟲科（英語：Tontoniidae）

俠盜亞目（英語：Strobilidiina）
- 李加德蟲科（英語：Leegaardiella）
- 羅曼蟲科（英語：Lohmanniella）
- 俠盜科（英語：Strobilidiidae）
- "擬盜科（英語：Strombidinopsidae）"

砂殼亞目
- 旋坎科（英語：Ascampbelliellidae）
- 圓泡科（英語：Cyttarocylididae）
- 網袋科（英語：Dictyocystidae）
- 網膜科（英語：Epiplocylididae）
- 真鈴科（英語：Eutintinnidae）
- 網紋科（英語：Favellidae）
- 閉鐘科（英語：Nolaclusiliidae）
- 杯狀科（英語：Ptychocylididae）
- 條紋科（英語：Rhabdonellidae）
- "領細殼科（英語：Stenosemellidae）"
- 砂殼科（英語：Tintinnidae）
- 筒殼科（英語：Tintinnidiidae）
- 波膜科（英語：Undellidae）
- 滑殼科

旋前管科

吻口亞綱（英語：Rhynchostomatia）

棒槌蟲目（英語：Dileptida）
- 棒槌蟲科（英語：Dileptidae）
- 雙大核蟲科（英語：Dimacrocaryonidae）
短頸蟲目（英語：Tracheliida）
- 短頸蟲科（英語：Tracheliidae）

"刺鈎亞綱"（英語：Rhynchostomatia）

纖口蟲屬
長吻蟲科（英語：Lacrymariidae）
刺鈎目
- 刷齒蟲科（英語：Enchelyodonidae）
- 平形蟲科（英語：Homalozoonidae）
- 側甲蟲科（英語：Pleuroplitidae）
櫛毛科（英語：Didiniidae）

側口目
- 裂口蟲科
- 刺葉蟲科（英語：Epiphyllidae）
- 漫遊蟲科
- 擬漫遊蟲科（英語：Paralitonotidae）
- 原漫遊蟲科（英語：Protolitonotidae）

刀口目
- 尖尾纖蟲科（英語：Acropisthiidae）
- 射纖蟲科（英語：Actinobolinidae）
- 鏟口蟲科（英語：Apertospathulidae）
- 斜吻蟲科（英語：Enchelyidae）
- 假全毛科（英語：Pseudoholophryidae）
- 刀口科（英語：Spathidiidae）
- 管葉科

毛口亞綱（英語：Trichostomatia）

前庭目（英語：Vestibulifera）
- 小袋蟲科
- 布奇纖蟲科（英語：Buetschliidae）
- 擬等毛科（英語：Paraisotrichidae）
- Protocaviellidae（英語：Protocaviellidae）
- Protohalliidae（英語：Protohalliidae）
- 密纖科（英語：Pycnotrichidae）

內大足目（英語：Macropodiniida）
- 食澱粉科（英語：Amylovoracidae）
- 內大足科（英語：Macropodiniidae）
- 多肋蟲科（英語：Polycostidae）

IsoEnto

等毛蟲科（英語：Isotrichidae）

內毛目（英語：Entodiniomorphida）

睫口亞目
- 睫口科（英語：Blepharocorythidae）
- 副內毛科（英語：Parentodiniidae）
- 假內毛科（英語：Pseudoentodiniidae）

內毛亞目
- 環鞘蟲科（英語：Cycloposthiidae）
- Gilchristidae（英語：Gilchristidae）
- 眉纖科（英語：Ophryoscolecidae）
- 內多纖科（英語：Polydiniellidae）
- 犀纖科（英語：Rhinozetidae）
- 內旋纖科（英語：Spirodiniidae）
- Telamodiniidae（英語：Telamodiniidae）
- 穴纖科（英語：Troglodytellidae）

"雙引號"表示併系群

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