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HIV亚型

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慢病毒属
SIV和HIV病毒的种系发生树。
科学分类 编辑
(未分级) 病毒 Virus
域: 核糖病毒域 Riboviria
界: 副核糖病毒界 Pararnavirae
门: 逆转录酶病毒门 Artverviricota
纲: 逆转录酶病毒纲 Revtraviricetes
目: 逆转录病毒目 Ortervirales
科: 逆转录病毒科 Retroviridae
亚科: 正逆转录病毒亚科 Orthoretrovirinae
属: 慢病毒属 Lentivirus

人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)
人类免疫缺陷病毒-2(HIV-2)

《疾病和有关健康问题的国际统计分类》编号
类型类型[*]
分类和外部资源
医学专科传染病科
ICD-10B20-B24
ICD-9-CM042-044
[编辑此条目的维基数据]

治疗人类免疫缺陷病毒感染的一大障碍是病毒的高遗传变异性。[1]HIV可分为两种主要类型:HIV-1型和HIV-2型。HIV-1与生活在西非的黑猩猩大猩猩体内发现的病毒有关,而HIV-2与西非的濒危灵长类白顶白眉猴英语Sooty mangabey体内发现的病毒有关。[2]HIV-1病毒向下可分为几组:其中,HIV-1的M组病毒数量占优,是艾滋病(AIDS)流行的肇因。基于基因序列数据,M组可进一步细分为各亚型。已知某一些亚型更具毒性或对不同药物具有抗药性。通常认为,HIV-2病毒的毒性比HIV-1低,也更不容易传播:尽管已知HIV-2也会导致艾滋病。

主要类型

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HIV-1

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HIV-1是本病毒最常见和最致病的毒株。科学家将HIV-1分为主组(M组)和两个或更多的次组:N组、O组和可能的P组。据信,各组分别代表着几次从SIV到人类的独立传染(然而同组的亚型则不是)。 在HIV-1的基因组全序列的6种可能的阅读框中,共发现了39条开放阅读框[3],但其中只有少数是功能性的。

M组

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M组的“M”代表主要即“Major”,这是迄今最常见的HIV类型,它感染了超过90%的HIV/AIDS病例。M组向下可分为多条演化支,被称为“亚型”;这些亚型也以一个字母表示。此外,不同的亚型可以重组成所谓的“流行重组形式”(Circulating Recombinant FormCRF),每一个CRF以一个数字代称。例如,CRF12_BF是B和F亚型的重组。

  • A亚型常见于西非。[4]
  • B亚型是欧洲、美洲、日本和澳大利亚的主要类型。[5]
  • C亚型是南非、东非、印度、尼泊尔和中国部分地区的主要类型。
  • D亚型通常仅出现在东非和中非。
  • (E亚型)曾用于描述名为CRF01_AE的毒株[6],其发现于东南亚(泰国),为异性恋中的主要类型:因为其传染率远高于其他大多数的亚型。
  • F亚型发现于中非、南美洲和东欧地区。[7]
  • G亚型(以及CRF02_AG)发现于非洲和中欧地区。
  • H亚型仅限于中非。
  • (I亚型)曾用于描述现今被认为是CRF04_cpx的毒株;其中,cpx用于表示几种亚型的“复合”重组。[来源请求]
  • J亚型主要发现于北非、中非、西非以及加勒比地区。[8]
  • K亚型仅限于刚果民主共和国和喀麦隆境内。

如上亚型有时会被进一步细分为亚亚型,例如A1、A2、F1和F2。[来源请求]

2002年的HIV-1亚型流行度

N组

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N组的“N”代表着“非M”即“non-M”、“非O”即“non-O”。该组是弗朗科-喀麦隆团队在1998年发现的。当时,他们在一位因艾滋病死于1995年的喀麦隆妇女身上鉴定并分离出了HIV-1毒株YBF380,并发现这一毒株会与来自SIVcpz(来自黑猩猩的猴免疫缺陷病毒)的包膜抗原发生反应,但不会与M组或O组的发生反应;这表明它确实是HIV-1的一种新毒株。[9]截至2015年,已记录到的N组感染少于20例。[10]

O组

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O组(“O”代表“离群者”,即“Outlier”)通常不在西非和中非以外的地区出现。据报道,该毒株最常见于喀麦隆:一项1997年的调查显示,当地共有2%的HIV阳性样本来自O组。[11]O组曾引起过一些关注,因为早期版本的HIV-1检测套件无法检测到该组毒株。然而,现在已经开发出了更先进的HIV检测方式来检测O组和N组。[12]

P组

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2009年,据报道,一条新近分析的HIV序列被认为更接近于在野生大猩猩身上新发现的猴免疫缺陷病毒(SIVgor),而非来自黑猩猩的SIVcpz。该病毒是从一位定居在法国的喀麦隆妇女身上分离出的,她在2004年被诊断感染有HIV-1病毒。报告这一序列的科学家将其列入拟议的P组,“等待确定其他人类病例”。[13][14][15]

HIV-2

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在非洲以外地区,HIV-2并未广泛流行。1987年,在美国发现第一例病例。[16] 许多检测HIV-1的套件亦可用于检测HIV-2。[17]

截至2010年,HIV-2病毒已知的分组共有8组(A到H)。其中,只有A组和B组流行。A组主要发现于西非,但已全球扩散到安哥拉莫桑比克巴西印度欧洲美国。尽管HIV-2有着全球范围的分布,但B组仍然主要限于西非。[18][19] 尽管其分布相对受限,诊断表现出HIV感染症状的患者时,需要考虑HIV-2的情况并不仅限于来自西非的患者,还应包括与来自西非的人有体液交换的患者(如共用针头、性接触等)。[20]

HIV-2与在白顶白眉猴英语Sooty mangabey中流行的猴免疫缺陷病毒(SIVsmm)关系密切,这一灵长类物种栖息在西非沿岸的森林里。种系发生分析显示,和在人类中显著扩散的两种HIV-2毒株(A组和B组)最密切相关的病毒,是在科特迪瓦西部塔伊森林的白顶白眉猴体内发现的SIVsmm。

另外6个已知的HIV-2组,每组均只有一名病例。它们可能分别来自从白顶白眉猴英语Sooty mangabey到人类的几次独立传染。在利比亚的两个人身上发现了C组和D组,在塞拉利昂的两个人身上发现了E组和F组,在科特迪瓦的两个人身上发现了G组和H组。上述每种HIV-2毒株(人类可能是其终结宿主)和来自所感染人类同一国的白顶白眉猴英语Sooty mangabey身上发现的SIVsmm毒株最为相关。[18][19]

诊断

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当患者没有症状,但存在HIV血液检测阳性结果时,可被诊断为HIV-2。Multispot HIV-1/HIV-2快速检测是目前唯一经FDA批准的区分这两种病毒的方法。可以识别出HIV-1、HIV-1的O组以及HIV-2的酶免疫测定,一直以来都是筛查和诊断HIV的推荐方法。[20]如果在组合筛查中发现测试结果虽为阳性,但HIV-1免疫印迹法却无法确定结果时,则还应进行氨基酸测试等后续测试,以区分感染类型。[21] 根据美国国立卫生研究院(NIH),当个体具有西非血统,或曾与具有该血统的其他人性接触或共用过针头时,应考虑可区分HIV-2的诊断方式。西非被列为最高风险,因为该病毒起源于这一地区。

治疗

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HIV-2的致病性被发现低于HIV-1。HIV-2的致病机理并不十分明确,它与HIV-1的具体差异亦不了解;然而,已知HIV-2的传播速率远低于HIV-1。两种病毒的感染都可以让感染者患上艾滋病,也都可以突变产生抗药性。[20]HIV-2患者的疾病监测包括临床评估和CD4细胞计数,而治疗手段包括使用抗逆转录病毒治疗(ART)、核苷逆转录酶抑制剂(NRTI)、蛋白酶抑制剂(PI)和非核苷逆转录酶抑制剂(NNRTI),并联合使用CCR5共受体拮抗剂和融合抑制剂。[22]

尚未确定对HIV-2的初始和二线治疗方案。HIV-2似乎本身对NNRTI有抗性,但可能对NRTI敏感,尽管目前对其机理不甚了解。蛋白酶抑制剂呈现的效果多变,整合酶抑制剂则尚在评估中。针对上述治疗的组合方案研究指出,其治疗效果受组合使用药物的不同而变化。尽管尚不明确HIV-1和HIV-2病毒的致病机理,但已知二者的致病途径和模式有所不同,使得用以评估HIV-1抗药性相关突变的算法,无法作用于HIV-2。[20]

两种病毒可以分别被感染,但也可以一起被感染:这被称为“共感染”。与单独的HIV-1感染或共感染相比,HIV-2似乎具有较低的致死率、较不严重的症状和较慢的艾滋病进程。然而,共感染的情况在很大程度上取决于先感染的是哪种病毒。HIV-1倾向于与HIV-2竞争疾病进程的速率。随着时间的推移,共感染在全球范围内似乎成为一个日益严重的问题:多数已确定的病例出现在西非国家,美国亦有一些此类病例。[22]

怀孕

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如果孕妇遭到暴露,应正常进行筛查。如果发现有HIV-2存在,可提供一些围产期的ART药物来降低出现母婴传播的风险。婴儿出生后,应开始为期6周的预防性疗程。母乳亦有可能含有HIV-2病毒,因此,严禁母乳喂养。[21]

演化

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HIV病毒正在演化为更温和的形式,但要成为不致死的病毒还有“极为漫长的路”。[23]

抗药性突变

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具有抗逆转录病毒药物抗性的HIV-1和HIV-2分离株产生于自然选择和基因突变,这些突变已被追踪和分析。斯坦福HIV耐药性数据库和国际艾滋病协会公布了最重要的一些突变。

参考文献

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  1. ^ Robertson DL, Hahn BH, Sharp PM; Hahn; Sharp. Recombination in AIDS viruses. J. Mol. Evol. March 1995, 40 (3): 249–59. PMID 7723052. doi:10.1007/BF00163230. 
  2. ^ Sharp, P. M.; Hahn, B. H. Origins of HIV and the AIDS Pandemic (PDF). Cold Spring Harbor Perspectives in Medicine. 2011, 1 (1): a006841–a006835 [2017-02-13]. PMC 3234451可免费查阅. PMID 22229120. doi:10.1101/cshperspect.a006841. (原始内容存档 (PDF)于2015-02-24). 
  3. ^ Dhar¹, D. V., Amit, P., & Kumar, M. S. In-Silico Identification of New Genes in HIV-1 by ORF Prediction Method.
  4. ^ Bobkov AF, Kazennova EV, Selimova LM, et al. Temporal trends in the HIV-1 epidemic in Russia: predominance of subtype A. J. Med. Virol. October 2004, 74 (2): 191–6. PMID 15332265. doi:10.1002/jmv.20177. 
  5. ^ Goudsmit, Jaap.
  6. ^ Human Immunodeficiency Virus Type 1 Subtype Distribution in the Worldwide Epidemic: Pathogenetic and Therapeutic Implications.. [2020-01-16]. (原始内容存档于2020-01-16). 
  7. ^ [1]页面存档备份,存于互联网档案馆) Introduction to HIV types, groups and subtypes.
  8. ^ Hemelaar J, Gouws E, Ghys PD, Osmanov S.; Gouws; Ghys; Osmanov. Global and regional distribution of HIV-1 genetic subtypes and recombinants in 2004. AIDS. March 2006, 20 (16): W13–23. PMID 17053344. doi:10.1097/01.aids.0000247564.73009.bc. 
  9. ^ T. Mourez, F. Simon, and J.C. Plantiera,. Non-M variants of human immunodeficiency virus type-1. Clinical Microbiology Reviews. 2013, 26: 448–461. doi:10.1128/cmr.00012-13. 
  10. ^ M. D’arc, A. Ayoubaa, A. Estebana, G. H. Learnc, V. Bouéa, F. Liegeoisa, L. Etiennea; et al. Origin of the HIV-1 group O epidemic in western lowland gorillas. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2015, 22 (1): 83–92. 
  11. ^ Peeters M, Gueye A, Mboup S, Bibollet-Ruche F, Ekaza E, Mulanga C, Ouedrago R, Gandji R, Mpele P, Dibanga G, Koumare B, Saidou M, Esu-Williams E, Lombart JP, Badombena W, Luo N, Vanden Haesevelde M, Delaporte E. Geographical distribution of HIV-1 group O viruses in Africa. AIDS. March 1997, 11 (4): 493–8. PMID 9084797. doi:10.1097/00002030-199704000-00013. 
  12. ^ 存档副本 (PDF). [2008-05-18]. (原始内容 (PDF)存档于2007-09-21). 
  13. ^ Plantier JC, Leoz M, Dickerson JE, De Oliveira F, Cordonnier F, Lemée V, Damond F, Robertson DL, Simon F. A new human immunodeficiency virus derived from gorillas. Nature Medicine. August 2009, 15 (8): 871–2. PMID 19648927. doi:10.1038/nm.2016. 
  14. ^ New HIV strain discovered. Associated Press (CBC News). 2009-08-03 [2009-08-03]. (原始内容存档于2009-08-05). 
  15. ^ Donald G. McNeil, Jr. Precursor to H.I.V. Was in Monkeys for Millennia. New York Times. September 16, 2010 [2010-09-17]. (原始内容存档于2011-05-11). But P appears to have crossed over from a gorilla; it was discovered only last year, and in only one woman, who was from Cameroon, where lowland gorillas are hunted for meat. 
  16. ^ HIV-2. [2017-02-13]. (原始内容存档于2013-01-15). 
  17. ^ CBER - Donor Screening Assays for Infectious Agents and HIV Diagnostic Assays. [2017-02-13]. (原始内容存档于2009-05-11). 
  18. ^ 18.0 18.1 Santiago, Mario L.; Range, Friederike; Keele, Brandon F.; Li, Yingying; Bailes, Elizabeth; Bibollet-Ruche, Frederic; Fruteau, Cecile; Noë, Ronald; Peeters, Martine; Brookfield, John F. Y.; Shaw, George M.; Sharp, Paul M.; Hahn, Beatrice H. Simian Immunodeficiency Virus Infection in Free-Ranging Sooty Mangabeys (Cercocebus atys atys) from the Taï Forest, Côte d'Ivoire: Implications for the Origin of Epidemic Human Immunodeficiency Virus Type 2. Journal of Virology. 2005, 79 (19): 12515–27. PMC 1211554可免费查阅. PMID 16160179. doi:10.1128/JVI.79.19.12515-12527.2005. 
  19. ^ 19.0 19.1 Marx PA, Alcabes PG, Drucker E. Serial human passage of simian immunodeficiency virus by unsterile injections and the emergence of epidemic human immunodeficiency virus in Africa. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2001, 356 (1410): 911–20 [2017-02-13]. PMC 1088484可免费查阅. PMID 11405938. doi:10.1098/rstb.2001.0867. (原始内容存档于2016-03-29). 
  20. ^ 20.0 20.1 20.2 20.3 存档副本. [2017-02-13]. (原始内容存档于2019-12-13). 
  21. ^ 21.0 21.1 Human Immunodeficiency Virus Type 2 (HIV-2) by New York State Department of Health AIDS Institute: http://www.hivguidelines.org页面存档备份,存于互联网档案馆
  22. ^ 22.0 22.1 R Kannangai, S David, G Sridharan.
  23. ^ HIV evolving 'into milder form'. [2017-02-13]. (原始内容存档于2019-04-22). 

外部链接

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